مباشر .. فإن اليعاقبة هم أتباع الكنيسة السورية الخاصة بيعقوب البرادعي، ويبدو أنه يعني أصحاب الطبيعة الواحدة بصفة عامة، وهذا يظهر من إشارته بأن معظم اليعاقبة أرمنيون، والمالكانية هم أتباع المدرسة التي اتفق على إنها الأرثوذكسية وهي مدرسة الروم اليونانيين والرومان.

ويفسر النسطورية بأنها مجمعة متأخرة انفصلت عن المذهب المقبول الشائع، وشكلت طائفة منفصلة. ولقد تضاءلت كنائس اليعاقبة والنساطرة أيام كاتب جلبي إلى قدر طفيف، وكانت كنائس الأرض والأقباط رعايا للحكم الإسلامي، ومن مثل هذه الاختلافات الأخيرة حدث الانشقاق الذي قسم الكنيسة المالكانية إلى أرثوذكسية يونانية شرقية وكاثوليكية رومانية غربية، والتقسيم الجديد في الكنيسة الكاثوليكية الرومانية الغربية، الذي كان سببه الإصلاح الديني البروتستانتي الذي نعتقد أنه أكثر أهمية بالنسبة للمراقب العثماني من المحاولات الأوروبية الخاصة باليعاقبة والنساطرة، ولم يذكر لنا "كاتب جلبي شيئا يذكر عن كل هذا).

إلا أن الاختلافات بين الكاثوليك والبروتستانت لم تصرف الاهتمام تماما فهناك شرح لأحد المؤرخين العثمانيين عن الحروب الدينية في وسط أوروبا. فهو يذكر لنا أنه في يوم ما .. كان إمبراطور النمسا يشعر بالحزن والاكتئاب بصورة اضحة والدموع تملا عينيه لدرجة أن روجة ابن ملك إسبانيا سألته عما يؤله. فقال إن سبب القلق هو الاختلاف بيني وبين السلطان العثماني. فكلما أرسل السلطان أوامره باستدعاء الأمراء الذين تحت سلطته ليأتوا بقواتهم للخدمة في جيوشه حضروا في الحال ووضعوا أنفسهم رهن إشارته دون شرط، أما حين يرسل إمبراطور النمسا هذه الرسائل إلى أمراء هنجاريا فإن تلك الرسائل لا تمثل موضوعة يشغلهم بحيث يقدمون له أية خدمة أو امتثالا لأوامره، وأجابت الامبراطورة على هذه الشكوى بقولها " إن محاربي الباشا العثماني منتمون إلى عقيدته وكيانه، وهذا هو سبب طاعتهم له، بينما يرفض امراؤك الهنجاريون الامتثال لك لاتهم على ديانة أخرى غير ديانتك، فاعجب الامبراطور بهذه الإجابة، وأرسل المبعوث والكهنة في الحال إلى الأمراء النهجاريين وأمرهم بالتحول