وعنه عليه السلام: أنه أمر علي بن أبي طالب رضي الله عنه أن يدعو عند ختم القرآن بهذا الدعاء وهو: <اللهم إني أسألك إخبات المخبتين، وإخلاص الموقنين، ومرافقة الأبرار، واستحقاق حقائق الإيمان، والغنيمة من كل بر، والسلامة من كل إثم، ووجوب رحمتك وعزائم مغفرتك، والفوز بالجنة والخلاص من النار> وفي شرح الجزري لابن المصنف: ينبغي أن يلح في الدعاء، وأن يدعو بالأمور المهمة والكلمات الجامعة، وأن يكون معظم ذلك أو كله في أمور الآخرة وأمور المسلمين، وصلاح سلاطينهم وسائر ولاة أمورهم في توفيقهم للطاعات، وعصمتهم من المخالفات، وتعاونهم على البر والتقوى، وقيامهم بالحق عليه، وظهورهم على أعداء الدين وسائر المخالفين، وبما كان يقول النبي عليه السلام عند ختم القرآن: <اللهم ارحمني بالقرآن العظيم، واجعله لي إماماً ونوراً وهدىً ورحمة، اللهم ذكرني منه ما نسيت، وعلمني منه ما جهلت، وارزقني تلاوته آناء الليل وأطراف النهار، واجعله حجة لي يا رب العالمين>، وكان أبو القاسم الشاطبي رَحِمَهُ اللهُ يدعو بهذا الدعاء عند ختم القرآن: اللهم إنّا عبيدك وأبناء عبيدك، وأبناء إمائك، ماض فينا حكمك، عَدْلٌ فينا قضاؤك، نسألك اللهم بكل اسم هو لك سميت به نفسك، أو علمته أحداً من خلقك، أو نزلته في شيء من كتابك، أو استأثرت به في علم الغيب عندك، أن تجعل القرآن ربيع قلوبنا، وشفاء صدورنا، وجلاء أحزاننا وهمومنا، وسائقنا وقائدنا إليك وإلى جناتك جنات النعيم، ودارك دار السلام مع الذين أنعمت عليهم من النبيين والصديقين والشهداء والصالحين، برحمتك يا أرحم الراحمين .... وتم تحرير روح البيان في تفسير القرآن في مدة الوحي تقريباً ... يوم الخميس الرابع عشر من جمادى الأولى المنتظم في سلك شهور سنة سبع عشرة ومائة وألف من هجرة مَن يرى من قدّام ومن خلف، وقلت في تاريخه نظماً:

إن مِنْ مَنِّ جناب ذي الْمِنَنْ ... ختم تفسير الكتاب المستطاب