إلا بالتربية والتعليم فلا تخلط السياسة بمقاصدك الإصلاحية لئلا تفسدها عليها فإنها ما دخلت في عمل إلا وأفسدته». ومع أنه قد حاول التبرير بأن ذلك لا يتعارض مع الاستمرار في الدعوة لفكرة الجامعة الإسلامية ومن خلال تصوره لها وهو التعاون والاتحاد بين أوطان العالم الإسلامي بعد إصلاحها والنهوض بها، إلا أن ذلك كان يعني أنه قد غلب الدعوة المصرية على حساب الفكرة الإسلامية (21).

ورأى محمد عبده أن تحقيق الوحدة السياسية بين بلدان العالم الإسلامي - وهم على ما هم عليه من تخلف وضعف - يعد ضربا من الجنون، حيث كان يرى أنه لكي تتحقق هذه الوحدة لا بد أن تسبقها حركة إصلاحية شاملة، وهو أمر دعاه لتأييد رجال تركيا الفتاة ومخالفة السلطان عبد الحميد، ودعاه أيضا إلى الاختلاف مع أستاذه جمال الدين مما اضطر جمال الدين إلى اتهامه بأنه (مثبط للهم، (22). بل لقد حاول محمد عبده أن يقنع أستاذه بانکاره حيث اقترح عليه، بعد أن تعطلت مجلة العروة الوثقى (أواخر سنة 1884 م) وبعد فشل مشروعات الجامعة الإسلامية، أن يعتزلا الاشتغال بالسياسة وأن ينشئا مدرسة التربية النشء وفقا لمنهج ومقاصد لتكوين صفوة من الشباب (23).

وكان من الطبيعي أن تلقى آراء محمد عبده تجاه الجامعة الإسلامية قبولا لدى أصحاب الثقافة الغربية أو من سموا أنفسهم بالمجددين من المفكرين المصريين، في حين لقي الشيخ بسبب هذه الآراء معارضة