(كيرلس الكبير الأول البابا الرابع والعشرون (412 – 444م) في أيامه ظهرت بدعة نسطور أسقف القسطنطينية ، ومؤداها (أن لسيدنا يسوع المسيح أقنومين أحدهما إنساني والثاني إلهي . وأن السيدة العذراء ليست والدة الإله بل والدة المسيح ) فكتب البابا كيرلس رسالة للرهبان والمتوحدين أدحض بها هذه البدعة وأثبت الإيمان الأرثوذكسى الصحيح . وهو (أن لسيدنا يسوع المسيح أقنوماً واحداً إلهياً اتحد بالطبيعة الإنسانية إتحاداً بدون اختلاط ولا امتزاج ولا استحالة ، وأن السيدة العذراء تدعي بحق والدة الإله) وكتب بعد ذلك إلي نسطور نفسه يرشده إلي الصواب كما كتب إلي القيصر تاودويسيوس وإلي امرأته وأخوته وكتب أيضاً إلي أسقف رومه فلم يعبأ نسطور برسالة البابا كيرلس وأصر على رأيه . أما أسقف رومه فعقد مجمعاً مكانياً حرم فيه نسطور وبدعته وحدد له عشرة أيام للتوبة . ولكن أسقف أنطاكية انتصر لنسطور وانشقت الكنيسة ......)

ويوضح كتاب رب واحد وكنيسة واحدة الذي سلفت الإشارة إليه ، أثر الانقسامات في الكنيسة بقوله في صفحتي 21 ، 22 منه :

(وإنه لمن الواضح أنه بموجب الكتاب المقدس فإن الكنيسة تقوم على صعيدين :

فهناك الكنيسة الجامعة غير المرئية والكائنة على الأرض وفي السماء ، وهناك أيضاً الطائفة المحلية التي تشكل نواة زماننا الحاضر ، ولا يكون عملنا مطابقاً لتعاليم العهد الجديد إذا دعونا تلك المنظمات (الكنسية) أمثال اللوثرية أو المثودسيثية أو الكاثوليكية أو غيرها. وانفصال هذه المنظمات سواء أكان ذلك حاصلاً في المدن أو في القرى ، بين الشعوب أو في العالم هو ما يجعل مشكلة الانقسام بارزة ولهذا يحق لنا أن نتساءل عن قيمة العهد الجديد ؟.)