للحكام الجدد الحنفيين.

... لكن هذه الحالة لم تدم طويلاً، إذ استعاد الجامع مكانته الأولى في تونس بداية من النصف الثاني للقرن الحادي عشر الهجريّ/ السابع عشر الميلاديّ، نظراً للأهمية التي يتمتع بها المذهب المالكي، وما يتمتع به الجامع من مكانة لدى مختلف الطبقات وخاصة منها العلماء. وفي أواسط القرن الثالث عشر الهجريّ/ التاسع عشر الميلاديّ، فقدت المدارس نهائياً دورها في ميدان التعليم، ما عدا دراسة الحديث. واستقل الجامع الأعظم بكل مواد الدراسة، وتواصل التعليم فيه حتى بداية النصف الثاني للقرن العشرين.