السلطان السلجوقي سليمان شاه وقابل الخليفة وتقرر في اللقاء أن للخليفة العراق ولسليمان شاه ما يفتحه من خراسان.

واستمرت المحاولات العباسية لتوطيد استقلالهم على أغلب مناطق العراق، فخرج الوزير ابن هبيرة لقتال قبيلة خفاجة في الجنوب سنة 556هـ، وتم في سنة 558هـ طرد بني أسد من الحلة، وحكمهم كان مثيرا للمشاكل في وجه العباسيين.

ولم تغير وفاة ابن هبيرة الأمر بل ظلت الأمور السياسية والعسكرية للعباسيين على ماهي عليه، وقد وصف ابن كثير الوزير الحنبلي ابن هبيرة صاحب كتاب " الإفصاح عن معاني الصحاح " فقال:" وزر للمقتفي ثم لابنه المستنجد وكان من خيار الوزراء وأحسنهم سيرة وأبعدهم عن الظلم، وقد كان يبالغ في إقامة الدولة العباسية وحسم مادة الملوك السلاجقة عنهم بكل ممكن حتى استقرت الخلافة في العراق كله ليس للملوك معهم حكم بالكلية ولله الحمد " (1)

وقد شهدت هذه الفترة بناء عدد من المدارس للحنابلة، منها مدرسة الوزير ابن هبيرة في باب البصرة، ومدرسة لعبدالقادر الجيلاني، ومدرسة لابن الجوزي بدرب دينار ومدرسة بنفشا الرومية مولاة المستضيء، غير أن هذه المدارس لم تستطع تأدية الدور الذي نجحت فيه المدرسة النظامية التي عززت الوجود الشافعي ببغداد عموما والأشعري خصوصا، ولا تفسير لذلك سوى أن المرحلة كانت مرحلة إدبار للحنابلة ورحيل عن بغداد.