وأبرز ما يميز هذه المرحلة التاريخية في بغداد أن الخلافة العباسية استعادت جزءا كبيرا من سلطتها واستقلالها، بعد أن خف الضغط المعتاد عليها من قبل ممالك الشرق، وذلك رغم فشل محاولة المسترشد بقتله سنة 529هـ، ومقتل الراشد على يد السلاجقة سنة 532هـ.
إلا أن الصراعات السلجوقية العنيفة بين السلطان مسعود والسلطان سنجر صرفت اهتمام السلاطين السلاجقة، ثم تنفست بغداد الصعداء بوفاة السلطان القوي مسعود سنة 547هـ، وتشتت مملكة السلطان سنجر سنة 548هـ.
كما ساهم في تحقيق الاستقلالية العباسية انشغال البيت الزنكي في معاركه ضد الصليبين في الشام، وقد حولت نجاحات نور الدين زنكي العسكرية الشام إلى منطقة جذب حالة بذلك محل بغداد، فتحول إليها الكثير من أمراء الحرب والعلماء والصلحاء والزهاد وطلاب الدنيا وطلاب الآخرة.
وكانت نتيجة هذا كله الاستقلال العباسي بالعراق، وكما هي العادة عند تحرر الخلافة العباسية من الهيمنة الخارجية فإنه يحدث تقارب بينها وبين القيادات السنية، ورافق ذلك ما أشرنا له سابقا بمشروع التعويض الحنبلي، فوصل عون الدين ابن هبيرة الحنبلي إلى الوزارة سنة 544 هـ، وكان لهذا الوزير حرص بالغ في توطيد دعائم الخلافة وتخفيف الضغط عليها، وقد شهدت الفترة اللاحقة حملات عسكرية للجيش العباسي، منها حملته
على جنوب العراق سنة 547هـ، وحملة على دقوقا شمال شرق بغداد سنة 550 هـ، وفي سنة 551هـ حدث ما يؤكد استقلال العباسيين، فقد زار بغداد