ثم تبع ذلك في سنة تسع وأربعين أن كبست دار أبي جعفر الطوسي متكلم الشيعة بالكرخ وأخذ ما وجد من دفاتر وكرسي كان يجلس عليه للكلام وأخرج إلى الكرخ وأضيف إليه ثلاثة مناجيق كان الزوار من أهل الكرخ قديما يحملونها معهم إذا قصدوا زيارة الكوفة فأحرق الجميع كما ذكر ابن الجوزي " (1)

ولاشك أن ذلك يعد نهاية عصر كما يعبر ابن كثير غير أن العصر اللاحق ظل مثقلا بمعطيات العصر السابق، فلم يزل للشيعة حضور واضح في بغداد، وهذا ما يفسر الفتن التي ستظهر بين الآونة والأخرى في بغداد لأسباب مختلفة ليس منها في الغالب إقامة مسيرات النواح في عاشوراء والاحتفالات يوم غدير خم. ولن تستطيع بغداد أن تتخلص من هذا الوجود كما حدث في الشمال الأفريقي سابقا وكما سيحدث في مصر لاحقا بسبب الوضع الجغرافي لبغداد وقربها من مراكز الشيعة في الجنوب.

ولم يعكر هذا الانتصار السني سوى ما حدث عند دخول البساسيري القائد التركي المناوئ للوجود السلجوقي والرافض لسياسات ابن المسلمة في بغداد، وكان دخوله في ذي القعدة من سنة خمسين وأربعمائة، بمساعدة قريش بن بدران العقيلي أمير الموصل الشيعي، وقد نجح في احتلال بغداد عقب أسر السلطان السلجوقي طغرلبك على يد أخيه إبراهيم ينال في همذان، ولم تفلح محاولات ابن المسلمة في استخدام العوام وتسليحهم، فدخل البساسيري بغداد وذكر أن أهل الكرخ الشيعة تلقوه ليدخل من عندهم فرحا