وروى القمي بسنده عن أبي جعفر الباقر في تفسير هذه الآيات أنه قال:"قوله تعالى:"أيحسب أن لن يقدر عليه أحد" قال:يعني عثمان في قتله ابنة النبي صلى الله عليه وآله. "يقول أهلكت مالا لبدا"، يعني الذي جهز به النبي من جيش العسرة"أيحسب أن لم يره أحد" قال:فساد كان في نفسه "ألم نجعل له عينين" يعني رسول الله:يعني رسول الله صلى الله عليه وآله."ولسانا"، يعني أمير المؤمنين(ع)."وشفتين":يعني الحسن والحسين عليهما السلام."وهديناه النجدين":إلى ولا يتهما".(تفسير القمي 2/423، وانظر تفسير الصافي: الكاشاني2/819، البرهان للبحراني 4/463، مقدمة البرهان لأبي الحسن العاملي ص74).
وقال هاشم معروف الحسني المحدث الشيعي المعاصر:"وتشير الروايات الكثيرة أن عثمان بن عفان لم يحسن صحبتها- أي رقية زوجه وهي ابنة رسول الله صلى الله عليه وسلم- ولم يراع رسول الله فيها فتزوج عليها أكثر من امرأة،، وماتت على أثر ضربات قاسية منه أدت إلى كسر أضلاعها.."(سيرة الأئمة الإثنى عشرية:هاشم الحسيني1/67).
وقد تهجم علامة الشيعة اللبناني المعاصر محمد جواد مغنية على عثمان رضي الله عنه في مواضع متعددة من كتابه(فضائل الإمام علي، دار ومكتبة الهلال ودار الجواد ببيروت، الطبعة الخامسة 1981م) ومن ذلك:
1-(إن الصراع بين قريش وعلي كان صراعا بين مصالح الأرستقراطيات التي يمثلها عثمان، ومصالح الجماعات التي يمثلها علي..فضائل الإمام علي ص 56-66).
2-(في عقيدتي أن خلافة عثمان كانت أهم حدث في تاريخ المسلمين، وأنها تركت أسوأ الأثر في حياتهم من يومها إلى قيام الساعة، فلقد أفسح المجال لبني أبيه الأمويين أن يعبثوا بالدين كما يعبث الصبيان بالكرة، وجاء قتله نتيجة حتمية لهذا الاستهتار كما كانت الحروب والفتن بين المسلمين نتيجة قتلة..فضائل الإمام علي ص81).
موقف الشيعة من طلحة والزبير رضي الله عنهما: