نبدأ بهذه العلوم من الطبيعة وكيف نظر إليها إخوان الصفاء 0 يرى الإخوان أن الطبيعة ، هي قوة النفس الكلية الفلكية وهي سارية في جميع الأجسام التي دون فلك القمر من لدن كرة الأثير الى منتهى مركز الأثير (1) والأجسام التي دون فلك القمر نوعان ، بسيطة ، ومُركبة 0 فالبسيطة أربعة أنواع وهي النار والهواء والماء والأرض 0 أما المركبة فهي ثلاثة أنواع وهي المعادن والنبات والحيوان 0 وقوى الطبيعة سارية فيها كلها ، وحركة ومسكنة ومدبرة لها ومتممة ومبلغة لكل واحدةٍ منها الى أقصى مدى غايتها حسب ما يليق بواحدة واحدة كما شاء باريها0 والنفس الكلية هي روح العالم والطبيعة فعلها والأركان الهيولى الموضوعة لها والأفلاك والكواكب كالأدوات لها ، والمعادن والنبات والحيوان كلها مصنوعاتها 0 فإذا كانت الصنائع البشرية يعملونها بأيديهم وأرجلهم ويستعملون مصنوعات طبيعية كالخشب مثلاً والحديد ... الخ من المواد 0 ويستعملون أدوات اتخذوها من مصنوعات الطبيعة كالفأس والمنشار ... الخ من الأدوات 0 فالهيولى هنا والأدوات خارجة عن ذواتهم ، أما الطبيعة فهيولاها من ذاتها التي هي الأركان الأربعة (2)