يمثل عصارة التجارب الجهادية التي سبقت في القرن الماضي، ويجمع هذا التنظيم بين تراث السلف الصالح وأفكار المدرسة النجدية وفكر سيد قطب رحمه الله.
وتقوم نظريته في الصراع على تركيز العمل العسكري "الجهاد" على العدو الحقيقي، وهو النظام العالمي بقيادة أمريكا، واستنزافه اقتصاديًا وعسكريًا حتى ينكفئ نوعًا ما، ويترك المجال لتصفية الحسابات مع الطواغيت المحليين الذين يحكمون بغير الشريعة ويوالون الغرب. وخصوصًا دول الطوق المحيطة بفلسطين، ومن بعد ذلك محاربة اليهود.
وهذا ليس استعداء من التنظيم للآخرين كما يظن البعض، بل هو ضرب للعدو الحقيقي الذي يباشر العدوان على الأمة صباح مساء، ويدعم اليهود دعمًا غير محدود، وإلا فهو لا يضرب الكفار ممن لا يباشرون العدوان على المسلمين، كالأرجنتين مثلاً.
وقد رأى تنظيم قاعدة الجهاد أنه لا يمكن الوصول لهؤلاء الطواغيت وإعادة دولة الإسلام وخلافته إلا عبر تفكيك هذا الحلف القائم بين الطواغيت المحليين وأسيادهم الدوليين، خصوصًا وأن تحرير فلسطين -وهو هدف من أهم أهدافه- لا يمكن إلا بعد تفكيك هذا الحلف، وإزالة العملاء من حكام دول الطوق وتثبيت الكيانات الجهادية في الدول المحيطة بفلسطين، حتى تتهيأ الأمة لخوض المعركة الكبرى والفاصلة مع اليهود. وهذا التفكيك يحتاج لجهد عسكري كبير تُزج فيه طاقات الأمة كلها، وليس طاقات جماعة بعينها مهما عظمت.
وحيث أن معظم الأمة بعيدٌ عن انتهاج الجهاد طريقًا للتغيير ..
وحيث أن معظم الأمة مكبلة بقيود ثقيلة تعوقها في طريقها، كسايكس بيكو ووعد بلفور ..
وحيث أن هناك حلفًا قويًّا بين الطاغوت المحلي والطاغوت الدولي ..
كان لا بد من توسيع نطاق المعركة على أكبر رقعة ممكنة، حتى يمثل ذلك صحوة للأمة ومحاولة لتفكيك هذا الحلف، واستنزافًا للعدو.
ومن أجل هذا ترى أن للتنظيم أفرعًا في كل منطقة أمكنه الامتداد إليها للقيام بالجهاد (1).
ومن أجل هذا أيضًا بدأ تنظيم القاعدة بضرب رأس الكفر العالمي .. أمريكا .. "رأس الأفعى" .. كما يسميها الشيخ أسامة رحمه الله.
ومن العمليات التي شنها المجاهدون بهذا الصدد: عملية المدمرة الأمريكية (كول)، واستهداف السفارتين الأمريكيتين في كل من نيروبي ودار السلام عاصمتي (كينيا وتنزانيا)، ثم جاءت غزوات الثلاثاء المباركة في الحادي عشر من سبتمبر حيث تم استهداف مبنيي مركز التجارة العالمي، ومبنى وزارة الدفاع الأمريكية (البنتاغون)، وكانت هذه الضربات صفعة قوية جدًّا وجهتها أمة الإسلام عبر طليعتها المجاهدة
(1) من أهم هذه الأفرع حاليًا: الشام واليمن والصومال والمغرب الإسلامي وشبه القارة الهندية وغيرها، فضلاً عن مركزه الأم في بلاد خراسان.