- ألّف / كتبًا نافعة. وهذه الكتب منها المطبوع، ومنها ما لم يُطبَع، وبعضها لا نعلم عنها شيئًا. منها:

• الاعتصام (وهو موضوع هذا التهذيب).

• الموافقات في أصول الفقه، وركَّزَ فيه على حِكَم الشريعة وأسرارها وأسرار التكليف.

• الإفادات والإنشادات، وهو عبارة عن فوائد وطرف ومُلَح وإنشادات نقلها الإمام الشاطبي / عن بعض شيوخه، وعن بعض من التقى بهم من العلماء.

• كتاب المجالس شرح فيه كتاب البيوع من صحيح البخاري.

• شرْح على الخلاصة في النحو.

• عنوان الاتفاق في علم الاشتقاق.

• فتاوى الإمام الشاطبي: وهذا الكتاب لم يؤلِّفه الشاطبي، وإنما جمعه الدكتور محمد أبو الأجفان من كتب مخطوطة ومطبوعة للشاطبي. وقد بلغت هذه الفتاوى ستين فتوى في الفقه والحديث والعقيدة ومسائل البدع.