وذكر القاضي منهج أبي جعفر في القراءة كالآتي:

1 - يقرأ بالبسملة بين كل سورتين إلا بين الأنفال وبراءة فله الأوجه الثلاثة المعروفة.

2 - يضم ميم الجمع ويصلها بواو إن كان بعدها حرف متحرك همزا كان أم غيره.

3 - يقرأ بإسكان الهاء في يؤده. نوله، ونصله، ونؤته، فألقه.

4 - يقرأ بقصر المنفصل وتوسط المتصل بقدر أربع حركات.

5 - يسهل الهمزة الثانية من الهمزتين المتلاقيتين في كلمة مع إدخال ألف بينهما.

سواء كانت الهمزة مفتوحة أم مكسورة أم مضمومة.

6 - يسهل الهمزة الثانية من الهمزتين المتلاقيتين في كلمتين المتفقتين في الحركة أما المختلفتان فيها فيغير ثانيتهما كما يغيرها نافع وابن كثير وأبو عمرو.

7 - يبدل الهمز الساكن مطلقا سواء كان فاء للكلمة أو عينها أو لامها.

8 - يدغم الذال في التاء في أخذتم وبابه. ويدغم الثاء في التاء في لبثت ولبثتم، والذال في التاء في عذت.

9 - يقرأ بإخفاء النون الساكنة والتنوين عند الخاء والغين مع الغنة نحو من خير من غفور، عليم خبير، عزيز غفور.

10 - يقف على كلمت «أبت» بالهاء حيث وردت.

11 - يفتح ما يفتحه قالون من ياءات الإضافة ويسكن ما يسكنه منها إلا ما استثنى.

12 - يوافق قالون في إثبات بعض الياءات الزائدة وصلا. ويوافق ورشا في إثبات بعضها. وينفرد بإثبات البعض الآخر كما هو مفصل في الكتب.

13 - يقرأ بضم تاء «للملائكة اسجدوا» في جميع المواضع.

14 - يسكت على كل حرف من حروف الهجاء الواقعة في أوائل السور مثل «الم» «كهيعص» سكتة لطيفة من غير تنفس.

15 - يقرأ «ونخرج له يوم القيامة كتابا» بالاسراء بالياء المضمومة في مكان النون المفتوحة، وبفتح الراء.

16 - يقرأ «ولا يتأل أولو الفضل منكم» في النور بتاء مفتوحة بعد الياء وبعد التاء همزة مفتوحة مع فتح اللام وتشديدها.

17 - يقرأ، نسقيكم مما في بطونه في المؤمنين والنحل بتاء مفتوحة مكان النون المضمومة.

18 - يقرأ، ولتصنع على عيني بسكون اللام وجزم العين في ولتصنع.