يقصد بمنهج التحقيق، الطريقة التي سار عليها المحقق في عمله في تحقيق الكتاب، بداية بمرحلة الاختيار وما يتعلق بها حتى نهاية التحقيق، وتقديمه للنشر. وقد عرف الفضلي التحقيق بأنه" الفحص العلمي للنصوص الأدبية من حيث مصدرها وصحة نصها وإنشاؤها وصفاتها وتاريخها" (الفضلي: 1402هـ، 32).

فالتحقيق ليس طريقاً ممهداً سهل العبور، وإنما هو درب شائك صعب المسلك، كثير العقبات، ومهمة التحقيق مهمة صعبة يكتنفها الكثير من الصعوبات، تتطلب من المحقق الحلم والصبر والأناة، ورسم طريقٍ واضحٍ يسير عليه من بداية اختيار النص المراد تحقيقه والعمل به، متوخياً في ذلك الحرص والدقة في