معظمها يجف أغلب أيام السنة لقلة المطر. وهي تمتلئ بالمياه إثر زخات المطر، وتفيض في فصل الربيع وأوائل فصل الصيف الذوبان الثلوج بسبب ارتفاع درجات الحرارة، وتشخ فيما عدا ذلك لشدة الحرارة التي تؤدي إلى زيادة التبخر وقلة التغذية والاستفادة ببعض ما يجري فيها للري.

ومن أهم هذه الأنهار:

أ- نهر جيحون:

ينبع من هضبة (بامير) ويجري في الشمال، ويشكل الحدود بين أفغانستان و ترکستان مسافة (130 کم)، ويتلفي تغذينه من ثلوج (بامبر) والجبال المشرفة على واديه سواء من جبال (هندکوش) من الجنوب أم مرتفعات ترکستان من الشمال، ويصب في بحيرة (خوارزم مشکلا جزبرة واسعة (دلتا)، وكان فيما مضى يصب في بحر الخزر (قزوين)، ويبلغ طوله (2240 كم)، ويفيض في أيام الربيع.

ومن الجدير بالذكر، أن البلاد الواقعة وراءه أطلق عليها المسلمون اسم: بلاد ما وراء النهر، نسبة إليه.

ومن المدن المشهورة التي تقع على هذا النهر مدينة (تزيد)، وهي على حدود أفغانستان ضمن جمهورية الأزبك.

ب - نهر هلمند:

يبدأ مجراه الأعلى من المرتفعات الوسطى من جبال (کوه بابا) من غربي مدينة (کابل)، كما تتدفق إليه المياه التي تنساب من الجبال الجنوبية الجبال (هندکوش) والسفوح الغربية للمرتفعات الشرقية عبر روافد كثيرة وأودية عديدة، واتجاه النهر نحو الجنوب الغربي ثم نحو الغرب، وأخيرة يتجه نحو الشمال ليصب في بحيرة (سيستان) على الحدود الأفغانية - الإيرانية.

ويبع طوله (1120کم)، ويروي وفروعه منطقة تزيد مساحتها على ثلث المساحة العامة الأفغانستان، وتقع في الجنوب الغربي من البلاد.