ولمكانته العلمية البارزة وبحوثه العلمية والتطبيقية الرائدة نال الأستاذ الدكتور شفيق بلبع جائزة الدولة التقديرية فى العلوم عام 1982م، وحصل على وسام الاستحقاق من الطبقة الأولى عام 1983م، ووسام العلوم والفنون من الطبقة الأولى عام 1978م، وعلى الميدالية الذهبية لأحسن بحث فى العقاقير عام 1972م من اتحاد الصيادلة العربى، وعلى جائزة نيوكومب التذكارية لأحسن بحث فى العقاقير على مستوى الولايات المتحدة الأمريكية عام 1954م.

... وامتد نشاط الدكتور بلبع وخبرته العلمية الواسعة على الساحة القومية فاختير مستشارًا ورئيسًا وعضوًا فى عدد كبير من الهيئات العلمية والمجالس العليا والجمعيات واللجان القومية ومنها:

ـ عضو المجلس القومى للتعليم والبحث العلمى، ومقرر شعبة التعليم الجامعى بالمجالس القومية المتخصصة.

ـ رئيس الأكاديمية المصرية للعلوم.

ـ مستشار مركز الأبحاث والرقابة الدوائية.

ـ مستشار النباتات الطبية والعطرية لوزارة الزراعة.

ـ عضو المجلس الأعلى لقطاع الدواء.

ـ نائب رئيس مجلس البحوث الطبية بأكاديمية البحث العلمى.

ـ رئيس اللجنة التنفيذية للبعثات.

ـ رئيس اللجنة الثقافية والتبادل الثقافى بالمجلس الأعلى للجامعات.

ـ عضو المجمع العلمى المصرى.

ـ عضو الجمعية الكيميائية الأمريكية الشرقية، والجمعية الأمريكية للنباتات الطبية والعقاقير، وعضو الاتحاد الدولى للصيدلة، والجمعية الأوربية للنباتات الطبية، والجمعية الصيدلية المصرية، والشعبة القومية للكيمياء البحتة والتطبيقية بأكاديمية البحث العلمى.