الأبعاد التي لا يزال يكتنفها الغموض، لكن هناك قرائن كثيرة تكشف عن إلمام ابن طفيل بعلم الهيئة وتجويده فيه. أما الشخصية الطبية لابن طفيل فتبرز في الرسالة في المواضع التي قدم فيها ابن طفيل وصفا بديعا للأعضاء الداخلية لحي بن يقظان أثناء تخلقه من الطينة المتخمرة، وأثناء تشريحه للظبية.

إن التجربة اللسفية لابن طفيل كما عرضها في رسالته لا تنفصل عن أساسها العلمي رغم نهايتها الغنية بالاستعارات والموغلة في التخييل. ولا غرو، فلقد ظلت الفلسفية عند ابن طفيل تتغذى بالعلم وتقوم عليه. وإن فهم شخصية فيلسوفنا