وتشير المصادر التاريخية إلى أن هذا الشعب عرف الإسلام منذ عهد معاوية رضي الله عنه، قبل أن يقوم بفتحها القائد العربي قتيبة بن مسلم الباهلي، الذي تمكّن في الفترة من (83- 94هـ - 702- 712م) من السيطرة علىربوع التركستان ونشر الإسلام بين أهلها، ودخل مدينة كاشغر عاصمة الإقليم عام 96هـ. وعن طريق الدعوة انتشر الإسلام في المناطق الداخلية، وقد أدى اعتناق حاكمها " عبد الكريم سوتوق بوغرا خان " للإسلام إلى دفع مسيرة المد الإسلامي هناك منذ عام960ميلادية، حيث حملوا لواء الدعوة الإسلامية إلى الصين وإلى مناطق متعددة في قارة آسيا. كما عرفوا اللغة العربية واستخدموا حروفها في كتابة لغتهم. إن الإسلام في تركستان الشرقية، قد أسس حضارة إسلامية راقية تمثلت في بناء العديد من المساجد في العديد من المدن والقرى، منها 300 مسجد في مدينة كاشغر وحدها، وأدت هذه المساجد جميعها دورا متميزا في نشر التعليم الإسلامي ونشر المفاهيم الإسلامية الصحيحة بين المسلمين هناك، هذا بالإضافة إلى الدور البارز في التعريف بهدايات وتعاليم الدين الإسلامي الحنيف. وبالرغم من تعدد القوميات الإسلامية هناك إلا أنها انصهرت جميعا في بوتقة واحدة هي القومية الإسلامية باعتبار أن الإسلام هو قومية جميع المسلمين.