وبعد انتهاء الحرب الباردة، وتفكك الاتحاد السوفيتي السابق وخروج دول تركستان الغربية من تحت عباءته، راحت السلطات الصينية تشدد قبضتها الحديدية على تركستان الشرقية، وتفرض تعمية مقصودة عن أخبار المسلمين هناك، وتمارس كل ما من شأنه الحيلولة دون تجدد الثورات في الإقليم، ومطالبة المسلمين بحق تقرير مصيرهم أسوة بإخوانهم في تركستان الغربية، وهذه خيانة عظمى بالنسبة للسلطات الصينية التي تدعي أن تركستان الشرقية جزءا لا يتجزأ منها، لاسيما بعد تزايد أهميتها الاقتصادية بالنسبة للصين. إذ يمكن القول أنها أصبحت عصب اقتصاد الصين في الوقت الراهن، وعصب صناعاتها الثقيلة والعسكرية، فالصواريخ الصينية النووية، والصواريخ البالستية عابرة القارات تنتج في تركستان الشرقية.

وقد أشدت وطأت القبضة الصينية الحديدة على المسلمين في تركستان الشرقية وفي باقي إقليم الصين أكثر وأكثر بعد هجمات 11سبتمبر 2001 وانتشار ظاهرة العداء للإسلام، واقتران اسم المسلمين باسم الإرهاب. ومنذ ذلك الحين وتهم الإرهاب تلاحق المسلمين وتزايدت الاعتقالات في صفوفهم بذريعة هذه التهمة. وفضلا عن ذلك قامت الصين بمنع المسلمين من إطالة اللحى والسيدات من ارتداء النقاب، ومنع المسئولين المحليين والطلبة والمدرسين من صوم شهر رمضان، وإجبار المسلمين على فتح المطاعم في نهار رمضان، وتتذرع السلطات الصينية بأن هذه الإجراءات تهدف إلى تأمين الأوضاع بالإقليم وتتهم الصين جماعات إسلامية في إقليم سينكيانج بالسعي لإعادة إقامة دولة إسلامية كانت قائمة باسم «تركستان الشرقية» ويعيش المسلمون حاليا والذين تدنت نسبتهم إلى 45% بعد أن كانت 95% من قبل يعيشون، في ظروف سيئة حيث ينتشر بينهم الفقر ويعانون من الحرمان من أبسط الحقوق.