وجاءت بعد ذلك مرحلة بروز الأحزاب السياسية في السودان في عامي 1943 – 1944 وأعلنت الأحزاب عن برامجها وأهدافها الوطنية، وبدا واضحا أنها كلها تلتقي على وحدة وادي النيل التقاء النيل الأزرق بالنيل الأبيض .. حتى أنه ليصح ان نسميها بالأحزاب الاتحادية..

ومثلا، فإن حزب الأشقاء، كان يدعو إلى قيام حكومة سودانية ديمقراطية ينشأ بينها وبين مصر اتحاد تحت التاج المصري، بحيث يكون ملك مصر هو ملك مصر والسودان معاً.

وفي أكتوبر 1944 تأسس حزب اتحادي آخر، عرف باسم حزب الاتحاديين، وقد نادى بالاتحاد مع مصر في إطار نظام "الدومنيون" .. وقد عارض حزب الأشقاء هذه الصيغة الهزيلة لأنهم رأوا في نظام "الدمنيون"، علاقة التابع بالمتبوع، تماما مثل علاقة "الدومنيون بالتاج البريطاني"..

ثم نشأ حزب اتحادي ثالث عرف باسم حزب الأحرار، وقد نص برنامجه أن تكون العلاقة بين مصر والسودان اتحادية ولكن على أساس كونفدرالي، وهو دون الصيغة الفدرالية، وهذه دون الصيغة الوحدوية.

ولكن النزعة الوحدوية في السودان كانت من العراقة والأصالة بحيث لا تقبل هذه المفارقات في صياغة الوحدة، لشعب واحد يقيم في وطن واحد، ويتطلع إلى مستقبل واحد، انطلاقا من ماض واحد، فكان أن اجتمعت الأحزاب الثلاثة واتفقت على صيغة وحدوية واحدة، فوضعت ميثاقا سياسياً اعلنته على شكل قرار ينص على "قيام حكومة سودانية ديمقراطية تكون متحدة مع مصر تحت التاج المصري".

وفي أكتوبر 1945 قطعت الوحدة خطوة كبرى على الطريق بحيث أصبحت تعبر عن جميع قطاعات شعب السودان فقد عقد اجتماع وطني كبير