ومن أبشع العمليات، التي كان يقوم بها الموساد الصهيوني، تهريب الأسلحة للمتطرفين المسلحين في صعيد مصر. في الوقت الذي كانوا يمارسون العمليات الإرهابية ضد المنشآت المصرية، ويمارسون القتل والترويع ضد الشعب العربي المصري. فقد ألقت السلطات المصرية في حزيران 1994 على الجاسوس الصهيوني (إسحق ديموند) وهو ضابط في جيش الكيان الصهيوني. وقد ألقي القبض عليه، وهو يحاول تهريب أجهزة تفجير إلى داخل مصر.
وفي تشرين الثاني من نفس العام، اصطادت السلطات الأمنية المصرية شبكة موسادية برئاسة الجنرال الصهيوني المتقاعد (بول مزراحي) وهي تحاول تهريب أسلحة للعصابات الإرهابية في الصعيد.
وما بين أعوام 1994 و 1996 عمل الموساد الصهيوني على تجنيد عدد من المصريين من العاملين سابقاً في القوات المسلحة، ليقوموا بالتجسس على القوات المسلحة المصرية. واستطاعت الأجهزة الأمنية المصرية إلقاء القبض عليهم، وكان من بينهم بحار تم تكليفه بالتجسس على المنشآت الهامة في الإسكندرية وتصوير تلك المنشآت. وعسكري آخر تم تجنيده من مدينة رفح. ورقيب بحري يدعى عثمان، كان يتجسس على البحرية المصرية، وكان ينقل المعلومات من خلال استخدام عملية الغطس، التي يتقنها من طابا إلى إيلات.
وألقي القبض على عسكري يدعى عبد الملك عبد المنعم حامد تم تجنيده، بعد تعاقده عام 1978. كما ألقي القبض على طبيب صهيوني كان يقوم بالتجسس في أيلول عام 1996.(5)