ويتبع لهذه الإدارة مجموعة من الإدارات التي تنسق وتنفذ الأعمال الإدارية والمالية في الرئاسة وهذه الإدارات هي: إدارة شؤون الموظفين، الشؤون المالية، المستودعات، الحركة والورشة، مركز الاتصالات، إدارة الأمن والسلامة، إدارة المشتريات، إدارة الحاسب الآلي ، قسم النسخ، ومراقبة المخزون.

بعض المهام:

1 - رسم السياسات والبرامج والخطط الإدارية والمالية للرئاسة حسب الصلاحيات والإشراف عليها.

2 - الإشراف على أعمال الشؤون الإدارية والمالية والموظفين والخدمات العامة للجهاز .

3 - تقديم تقرير عن الأعمال والمناشط الإدارية والمالية نصف سنوي للمسؤولين.

4 - المشاركة في إعداد الميزانية وتحضيرها ومناقشتها مع الجهات ذات العلاقة.

5 - الإشراف على تأمين احتياجات الرئاسة وفروعها من أدوات مكتبية وأثاث وغيره .

6 - ممارسة الصلاحيات الممنوحة لها من الرئيس العام

. الإدارة العامة للقضايا والتحقيق

الهدف: تحديد أوجه المخالفات الشرعية ورصد الظواهر المخالفة لأحكام الدين ، وتحديد أسبابها واقتراح الإجراءات المناسبة لها حسب نظام الهيئة.

بعض المهام :-

1 - الإشراف والمتابعة على أعمال إدارات القضايا بالفروع.

2 - الإشراف والمتابعة على إعداد الدراسات اللازمة التي تقوم بها لفروع عن الظواهر الخاطئة والرفع عنها للمسؤولين بالرئاسة .

3 - التأكد من سلامة الإجراءات المتخذة في القضايا من قبل الفروع .

4 - الاطلاع على الإحصائيات الدورية المرفوعة من الفروع وتقييمها وتحليلها واقتراح التوصيات اللازمة.

5 - الإشراف على الأعمال الميدانية للفروع.

الإدارة العامة للتوعية والتوجيه

الهدف: التوعية والتوجيه ومعالجة البدع ودراسة الظواهر الاجتماعية واقتراح طرق معالجتها.

بعض المهام :-

1 - الإشراف على أعمال إدارات التوعية والتوجيه بالفروع وتزويدهم بالتعليمات.

2 - توجيه وتوعية العاملين بالميدان بالرئاسة عبر المحاضرات والندوات والدروس المفيدة.