تخرج بالآيات القرآنية عن معانيها اللغوية ومدلولاتها الشرعية، وهي التي وصفها بالبعث كما قدمنا. أما الفئة الثالثة، فئة التوسط بين جانبي الإفراط والتفريط، فهي لم تتجمد جمود الفئة الأولى، ولم تتهور تهور الفئة الثانية، وهذه الفئة قامت بما يلي:
1) أخذت الآيات التي لها مساس بالعلوم وفهمتها بناء على ضوء المعارف الحديثة اليقينية لا الظنية، وفي نطاق قوانين الشرع العامة وقواعد اللغة الثابتة، فرأت فيها كل ما يدل كل ذي عقل على أن هذا القرآن ليس من عند البشر وإنما من عند الله.
2) وقفت عند ظاهرة النص القرآني إذا كانت دلالته قطعية، وإن كان يتعارض مع بعض النظريات العلمية الرائجة، جازمة بأن الخطأ في النظرية العلمية، وأن على أصحابها أن يبحثوا عن وجه الصواب في موضوعها مستندة على أن العلم لا يتناقض مع الدين، أو القرآن مع القوانين اليقينية الثابتة.
هكذا، يعرض الدكتور محمد حسن هيتو منهجه في الإعجاز القرآني في كتابه «المعجزة القرآنية»، متسلّحا بكل الضوابط التي وضعها العلماء، فكان كتابه خير نموذج للتفسير العلمي للقرآن، حيث فسّر فيه اثني وعشرين آية قرآنية بضوء مفردات العلم الحديث، كما أنه رد على مفهوم الإعجاز العددي في القرآن، كما ورد عن رشاد خليفة، وربطه بالتفسير الباطني اليهودي، فهو يرفض أن يضع في القرآن ما ليس فيه بحجة التفسير العلمي، كما فعل رشاد خليفة. إن كتاب «المعجزة القرآنية» هو خير نموذج للتفسير العلمي للقرآن، مبدأ ومنهجا وتطبيقا، وبمقدار ما نقرأ فيه من علوم ومعارف نجد فيه وظيفة القرآن في الدعوة والإرشاد والهداية متحققة، فلا نضيع وسط معلومات عن أنظمة الخلق والمخلوقات وننسى رب الخلق ورب المخلوقات وأنظمتها وقوانينها.
وإذا ما أخذنا نموذجا تطبيقيا لمنهج الدكتور محمد حسن هيتو، فإننا سنرى مقدار وضوح الإعجاز العلمي في الآيات القرآنية التي يختارها منه. ففي تفسيره العلمي للآية الثامنة عشرة، والتي وضعها تحت عنوان (وَمِنْ كُلِّ شَيْءٍ خَلَقْنا زَوْجَيْنِ لَعَلَّكُمْ تَذَكَّرُونَ) [الذاريات / 49] وشعار (علماء الكون والحياة في قانون الزوجية اليقيني) يقول: «لقد تكرر ذكر الأزواج في القرآن الكريم من أوله إلى آخره مرات كثيرة، وفي جوانب متعددة من جوانب الحياة، بل نصت بعض الآيات على أن كل شيء خلق في هذا الكون خلق على قانون الزوجية، فقال تعالى (وَتَرَى الْأَرْضَ هامِدَةً فَإِذا أَنْزَلْنا عَلَيْهَا الْماءَ اهْتَزَّتْ وَرَبَتْ وَأَنْبَتَتْ مِنْ كُلِّ زَوْجٍ بَهِيجٍ) [الحج / 5]، وقال تعالى