2-قسم قاعدة المعلومات: ويختص بتلقي المعلومات المتعلقة بأهداف المركز ومجالات عمله وتصنيفها وتوثيقها وتخزينها في أجهزة الحاسب وجعلها في متناول الباحثين والجامعات والمراكز المتخصصة، ويتبع هذا القسم مكتبة متخصصة ومركز للحاسب الآلي ووحدة للصيانة.
3- قسم المخطوطات والوثائق: ويختص هذا القسم بجمع المخطوطات والوثائق أو صورها عن المدينة المنورة حيثما وجدت، ويهتم بحفظها ودراستها وإعداد فهارس عامة وفهارس تفصيلية عنها، وتحقيق المخطوطات التي يتقرر تحقيقها في المركز، وإخراج دراسات من واقع الوثائق التي يقتنيها.
4-المكتبة:
تتبع الأقسام العلمية مكتبة عامة متخصصة بكتب المدينة المنورة ومصادر دراستها وفيها قسم للمؤلفات بغير اللغة العربية ، وتستقبل المكتبة إضافة للعاملين في الأقسام العلمية الباحثين والمراجعين من خارج المركز.
إنجازات المركز:
تم خلال فترة الإعداد لإنشاء المركز وحتى تاريخ صدور هذا العدد إنجاز الأعمال التالية:
ـ إنشاء مكتبة عن المدينة المنورة تجمع الكتب المتخصصة فيها والمصادر والمراجع التي تحوي معلومات عنها.
ـ إنشاء قاعدة معلومات بالحاسب الآلي عن المدينة المنورة تتضمن معلومات واسعة عن معالم المدينة المنورة وأعلامها وأحداثها التاريخية والنشاطات الحيوية: التعليم - الصحة - الصناعة- التجارة- الزراعة - الخدمات الفندقية- المواصلات- والاتصالات - الجمعيات والأندية- العادات والتقاليد...إلخ.
ـ إعداد برامج عن المدينة المنورة مسجلة على أسطوانات ليزر، هي: زيارة إلى المدينة المنورة، وموسوعة المدينة المنورة، وعمارة المسجد النبوي الشريف عبر التاريخ. ويجري تسويقها بالتعاون مع مؤسسات محلية.
ـ إعداد فيلم وثائقي إعلامي عن المدينة المنورة بعنوان: المدينة المنورة تاريخ وحضارة بسبع لغات.
ـ جمع 200 مصورة ورقية وفلمية لمخطوطات عن المدينة المنورة.