ونظمت كلية الدراسات الشرقية سلسلة من المحاضرات حول مصر، وقدمت دروساً في اللغة العربية للضباط والجنود الأمريكيين في منطقة الشرق الأوسط، وهيأت الجامعة مختبراتها العلمية لكي يجري "مركز إمدادات الحلفاء بالشرق الأوسط" تجاربه وبحوثه.

وكان ينظم كافة هذه الأنشطة عقود مبرمة بين الجامعة والحكومة الأمريكية مما زاد من عمق التعاون القائم بين الطرفين، فلقد تكون "معهد الولايات المتحدة الأمريكية للقوات المسلحة" في فبراير سنة 1943م بهدف تقديم دراسات في مستوى التعليم الثانوي والجامعي عن طريق المراسلة للعاملين بكل فروع الجيش الأمريكي، وكان المعهد في حاجة إلى مكاتب محلية لتسجيل الدارسين، والحصول على المواد التعليمية منها، وتصحيح أوراق الامتحانات، ووقعت الجامعة الأمريكية في أغسطس 1943م عقداً بهذا الخصوص، استجابة لمطلب قيادة الجيش الأمريكي بالقاهرة، أقيم على أساسه فرع الشرق الأوسط لمعهد الولايات المتحدة للقوات المسلحة بالجامعة الأمريكية في القاهرة.

وتولت فرقة عسكرية يقودها الضابط "أوتو كروشار" والضابط "هارولد هاند" مهمة الإشراف على البرنامج الذي أثبت نجاحاً هائلاً في تحقيق أهدافه، وحين أغلق فرع المعهد أبوابه في سبتمبر 1945م، كان قد استفاد أكثر من 1500 دارس من أنحاء متفرقة من الشرق الأوسط بخدماته، كما وفر المعهد تدريبات للعاملين المدنيين بالجيش من موظفي الإدارة والسكرتارية.