وقتل رضي الله عنه شهيدا يوم الجمعة يوم عاشوراء في المحرم سنة إحدى وستين وهو ابن ست وخمسين سنة . وقال أهل السير إن الله عز وجل قتل بسبب يحيى بن زكريا خمسة وتسعين ألفا وذلك دية كل نبي . ويروى أن الله تعالى أوحى إلى رسول الله صلى الله عليه وسلم : ' إني قتلت بيحيى بن زكريا خمسة وتسعين ألفا ولأقتلن بالحسين ابن بنتك قدر ذلك مرتين ' . وروي أنه لما قتل الحسين رضي الله عنه احتزوا رأسه وقعدوا في أول مرحلة يشربون ، فخرج عليهم قلم من حديد من حائط فكتب عليه سطرا : أترجو أمة قتلت حسينا . . . شفاعة جده يوم الحساب وأنشدت أخته زينب المدفونة بقناطر السباع من مصر المحروسة برفع صوت ورأسها خارج من الخباء : ماذا تقولون إن قال النبي لكم . . . ماذا فعلتم وأنتم آخر الأمم بعترتي وبأهلي بعد مفتقدي . . . منهم أساري ومنهم ضمخوا بدم ما كان هذا جزائي إذ نصحت لكم . . . أن تخلفوني بسوء في ذوي رحمي وحملت رأسه إلى مصر ودفنت بالمشهد المشهور بها ، ومشى الناس أمامها حفاة من مدينة غزة إلى مصر تعظيما لها رضي الله عنه . ومنهم رجال من سادات التابعين أولهم أويس القرني رضي الله تعالى عنه كان من أكابر الزهاد رث البيت قليل المتاع وكان أشهل ذا صهوبة بعيد ما بين المنكبين معتدل القامة ، آدم شديد الأدمة ضاربا بذقنه إلى صدره ، راميا ببصره إلى موضع سجوده واضعا يمينه على شماله ، وكان له طمران من الثياب وكان يتزر بإزار من صوف خامل الذكر لا يؤبه له ، وكان إذا أمسى يقول اللهم إني أعتذر إليك اليوم من كل كبد جائع فإنه ليس في بيتي من الطعام إلا ما في بطني ، وكان رضي الله عنه يقول إن الأمر بالمعروف والنهي عن المنكر لم يدع للمؤمن من صديق فكلما أمرناهم بالمعروف شتموا أعراضنا ووجدوا على ذلك أعوانا من الفاسقين حتى والله لقد رموني بالعظائم . قال بشر الحافي رضي الله عنه وبلغ من ورع أويس رضي الله عنه أنه جلس في قوصرة من العرى فهذا هو الزهد ، وكان رضي الله عنه يقول : لا ينال الناس هذا الأمر حتى يكون الرجل كأنه قتل الناس أجمعين ، وقال له رجل أوصني فقال فر إلى ربك قال فمن أين المعاشر ؟ فقال إن القلوب يخالطها الشك أتفر إلى الله لدينك وتتهمه في رزقك ،