الكتابات التي ترجمها حنين بن إسحاق كثيرة، ويمكن تتبعها من رسالته (1) إلى علي بن يحيى، وهي على النحو التالي :

1- فينكس : أي الفهرست

2- كتاب في مراتب قراءة كتبه

3- كتاب الفرق

4- كتاب الصناعة الصغيرة

5- كتاب النبض الصغير

6- كتاب جالينوس إلى أغلوقن

7- كتاب في العظام

8- كتاب في العضل

9- كتاب في العصب

10- كتاب في العروق

11- كتاب الأسطقسات

12- كتاب المزاج

13- كتاب القوى الطبيعية

14- كتاب العلل والأعراض

15- كتاب تعرف على علل الأعضاء الباطنة

16- كتاب النبض الكبير

17- كتاب أصناف الحميات

18- كتاب البحران

19- كتاب أيام البحران

20- كتاب حيلة البرء

21- كتاب علاج التشريح

22- كتاب فيما وقع من الاختلاف بين القدماء في التشريح

23- كتاب تشريح الأموات

24- كتاب تشريح الأحياء

25- كتاب في علم أبقراط بالتشريح

26- كتاب في آراء أراسطراطس بالتشريح

27- كتاب في تشريح الرحم

28- كتاب في حركة الصدر والرئة

29- كتاب في علل النفس

30- كتاب في الصوت

31- في حركة العضل

32- مقالة في مناقضة الخطأ الذي اعتقد من تمييز البول من الدم

33- مقالة في الحاجة إلى النبض

34- مقالة في الحاجة إلى التنفس

35- مقالة في العروق الضوارب، هل يجري فيها الدم بالطبع أم لا ؟

36- كتاب في قوى الأدوية المسهلة

37- كتاب في العادات

38- كتاب في آراء أبقراط وأفلا طن

39- كتاب في الحركة المعتاصة

40- كتاب في آلة الشم

41- كتاب منافع الأعضاء

42- مقالة في أفضل هيئات البدن

43- مقالة في خصب البدن

44- مقالة في سوء المزاج المختلف

45- كتاب الأدوية المفردة

46- مقالة في دلائل علل العين

47- مقالة في أوصاف الأمراض

48- كتاب الامتلاء

49- مقالة في الأورام

50- مقالة من الأسباب البادية

51- مقالة في الأسباب المتصلة بالأمراض

52- مقالة في الرعشة والنافض والاختلاج والتشنج

53- مقالة في أجزاء الطب

54- كتاب المني